Hubungan Malaysia–Filipina (Filipina: Ugnayang Malaysia–Pilipinas) merujuk kepada hubungan luar negeri antara Malaysia dan Filipina. Filipina memiliki sebuah kedubes di Kuala Lumpur, dan Malaysia memiliki sebuah kedubes di Manila dan sebuah konjen di Kota Davao. Rakyat dari dua negara tetangga tersebut memiliki sejarah hubungan kebudayaan dan politik yang panjang.[1]
Mereka sama-sama merupakan anggota pendiri ASEAN, kedua negara tersebut adalah saham Malayo-Polinesia, dan keduanya adalah mitra dagang penting. Dua negara tersebut ikut serta dalam konservasi dan keamanan bersama di Laut Sulu, yang membentang di antara dua negara tersebut.
